Morioka est un important carrefour ferroviaire du nord de Honshu, situé sur le Tohoku Shinkansen entre Sendai, Aomori et le corridor de Tokyo. La ville compte une principale gare ferroviaire longue distance, Morioka Station, desservie par JR East et l’IGR Iwate Galaxy Railway. Morioka est aussi le point de jonction où les trains Akita Shinkansen quittent la ligne Tohoku Shinkansen en direction de la préfecture d’Akita.
Les trains au départ de Morioka comprennent les services Shinkansen de JR East, les trains régionaux JR East à travers la préfecture d’Iwate, ainsi que les services de l’IGR Iwate Galaxy Railway au nord de la ville. Morioka Station prend en charge les trains à grande vitesse, des services locaux et régionaux limités, ainsi que les correspondances entre les Shinkansen et les lignes ferroviaires conventionnelles. Il n’existe pas de gare ferroviaire directe à l’aéroport d’Iwate Hanamaki, donc les voyageurs en train utilisent généralement Morioka Station puis effectuent un transfert routier.
Les lignes ferroviaires depuis Morioka partent vers le sud en direction de Sendai, Fukushima, Utsunomiya et Tokyo, vers le nord en direction de Hachinohe, Shin-Aomori et Aomori, vers l’ouest en direction de Kakunodate et Akita, et vers l’est en direction de Miyako sur le versant Sanriku d’Iwate. Réservez en ligne des trains au départ et à destination de Morioka sur Rail Monsters.