Nagano dispose de services ferroviaires importants qui le relient à diverses régions. La gare principale, la gare de Nagano, est un arrêt essentiel sur la ligne Hokuriku Shinkansen, offrant un accès rapide à Tokyo, Kanazawa et Toyama. De plus, des lignes locales telles que la Nagano Electric Railway relient les destinations proches de Yudanaka et Shibu sur la ligne Nagaden. La gare accueille également des services vers les zones montagneuses environnantes qui attirent les visiteurs, notamment pendant la saison hivernale pour le ski. Dans l'ensemble, les connexions ferroviaires garantissent des options de voyage pratiques vers et depuis Nagano.