Noboribetsu se trouve sur la ligne principale Muroran de JR Hokkaido, dans le sud de Hokkaido, entre Tomakomai et Higashi-Muroran. La ville compte une principale gare interurbaine, la gare de Noboribetsu, qui sert d’arrêt aux trains rapides limités et aux trains locaux plutôt que de terminus. Son rôle ferroviaire est lié au corridor Sapporo - Hakodate, l’un des axes ferroviaires conventionnels les plus importants de Hokkaido.
Les trains au départ de Noboribetsu comprennent des services rapides limités de JR Hokkaido tels que Hokuto sur l’axe Sapporo - Hakodate, des services Suzuran en direction de Sapporo et Muroran, ainsi que des trains locaux sur la ligne principale Muroran. Le réseau Shinkansen japonais n’atteint pas Noboribetsu ; l’accès au train à grande vitesse nécessite un passage par Shin-Hakodate-Hokuto, dans le sud de Hokkaido.
Les lignes ferroviaires au départ de Noboribetsu se dirigent vers le nord-est en direction de Tomakomai, Minami-Chitose, des correspondances pour l’aéroport de New Chitose et Sapporo, et vers le sud-ouest en direction de Higashi-Muroran, Toya, Oshamambe, Shin-Hakodate-Hokuto et Hakodate. Pour les déplacements régionaux, les trains locaux de JR Hokkaido relient Noboribetsu aux gares voisines de la région de Muroran. Réservez en ligne vos trains au départ et à destination de Noboribetsu sur Rail Monsters.