Tomakomai è ben collegata dalla ferrovia, offrendo diverse tratte chiave per i viaggiatori. La tratta da Tomakomai a Sapporo è lunga circa 70 chilometri e di solito richiede circa 1 ora e 15 minuti. Un'altra tratta significativa è Tomakomai a Hakodate, che copre circa 140 chilometri, con un tempo di viaggio di circa 2 ore. Inoltre, c'è un collegamento da Tomakomai ad Asahikawa, che si estende per circa 150 chilometri e richiede di solito circa 2,5 ore. Sono disponibili anche servizi per l'Aeroporto di New Chitose, che forniscono un accesso conveniente ai voli aerei.