Токио является центральным железнодорожным узлом в Японии, с несколькими крупными станциями, обеспечивающими широкий спектр вариантов поездок. Станция Токио функционирует как основной терминал для служб Синкансэн, соединяющих с такими городами, как Осака, Киото и Хаката. Станция Синдюку, признанная самой загруженной железнодорожной станцией в мире, обслуживает местные и экспресс-услуги в такие районы, как Иокогама и Кавасаки. Станция Сибуя предоставляет дополнительные соединения для пригородных и региональных поездов. Для достижения аэропортов Нарида Экспресс и Кейсэй Скайлайнер соединяют Токио с аэропортом Нарида, тогда как Токийский монорельс и линия Кейкю обеспечивают доступ к аэропорту Ханэда. С сочетанием 13 линий Синкансэн и обширной местной железнодорожной сети, поездки в Токио и из Токио хорошо поддерживаются.