Tomakomai est bien connectée par rail, offrant plusieurs itinéraires clés pour les voyageurs. L'itinéraire de Tomakomai à Sapporo mesure environ 70 kilomètres et prend généralement environ 1 heure et 15 minutes. Un autre itinéraire significatif est celui de Tomakomai à Hakodate, couvrant environ 140 kilomètres, avec un temps de trajet d'environ 2 heures. De plus, il existe une connexion de Tomakomai à Asahikawa, s'étendant sur environ 150 kilomètres et prenant généralement environ 2,5 heures. Des services vers l'aéroport de New Chitose sont également disponibles, offrant un accès pratique aux voyages aériens.