Nagano charakteryzuje się znacznymi usługami kolejowymi, które łączą je z różnymi regionami. Główna stacja, Stacja Nagano, jest ważnym przystankiem na linii Hokuriku Shinkansen, zapewniając szybki dostęp do Tokio, Kanazawy i Toyamy. Dodatkowo lokalne linie, takie jak Nagano Electric Railway, łączą pobliskie miejsca, takie jak Yudanaka i Shibu na linii Nagaden. Stacja obsługuje również usługi do okolicznych górskich obszarów, które przyciągają turystów, szczególnie w sezonie zimowym na narty. Ogólnie rzecz biorąc, połączenia kolejowe zapewniają wygodne opcje podróży do i z Nagano.