Shinagawa to jeden z głównych węzłów kolejowych Tokio, położony po południowej stronie centralnej sieci kolejowej stolicy. Obszar koncentruje się wokół stacji Shinagawa, kluczowego przystanku na Tokaido Shinkansen i węzła przesiadkowego dla usług JR East oraz Keikyu. Jego znaczenie kolejowe wynika z dalekobieżnych połączeń na zachód z Tokio oraz dojazdu na lotnisko Haneda.
Połączenia z Shinagawa obejmują pociągi dużych prędkości JR Central na Tokaido Shinkansen, miejskie i regionalne pociągi JR East na liniach takich jak Yamanote Line, Keihin-Tohoku Line, Tokaido Line, Yokosuka Line oraz pociągi Keikyu w kierunku lotniska i wybrzeża Kanagawy. Stacja Shinagawa jest główną stacją dla biletów kolejowych obejmujących dalekobieżne podróże Shinkansen, natomiast pobliska Takanawa Gateway obsługuje lokalne połączenia JR East w obrębie Tokio.
Trasy kolejowe z Shinagawa biegną na zachód do Nagoi, Kioto, Osaki i Hiroszimy przez korytarze Tokaido i Sanyo Shinkansen, na południe do Jokohamy i Kamakury liniami JR East oraz na południowy wschód na lotnisko Haneda pociągami Keikyu. Zarezerwuj pociągi do i z Shinagawa online w Rail Monsters.