Nagano ist ein Bahnknotenpunkt in Zentraljapan an der Hokuriku Shinkansen, gelegen zwischen dem Großraum Tokio und der Hokuriku-Region. Die Stadt hat einen wichtigen Fernbahnhof, den Bahnhof Nagano, sowie zusätzliche lokale Haltepunkte, die von regionalen und privaten Bahnunternehmen genutzt werden. JR East, JR Central, Shinano Railway und Nagano Electric Railway bedienen die Stadt.
Zu den Zugverbindungen ab Nagano gehören Hokuriku-Shinkansen-Schnellzüge, Limited-Express-Züge Shinano, regionale JR-East-Verbindungen auf der Shinonoi-Linie, lokale Shinano-Railway-Züge und Verbindungen der Nagano Electric Railway in Richtung Norden der Präfektur Nagano. Der Bahnhof Nagano ist der wichtigste Bahnhof für Fernzüge ab Nagano und für die meisten online gebuchten Zugtickets.
Die Bahnstrecken ab Nagano verlaufen südöstlich in Richtung Tokio und Ueno, nordwestlich in Richtung Toyama und Kanazawa, südlich in Richtung Matsumoto und Nagoya sowie nördlich in Richtung Myoko-Kogen und zu lokalen Zielen im Becken von Nagano. Regionale Verbindungen verbinden Nagano außerdem mit Ueda, Karuizawa und Yudanaka. Buchen Sie Züge von und nach Nagano online bei Rail Monsters.